中国科学院环境生物技术重点实验室，前身为环境生物技术实验室，创建于1995年，2010年经中国科学院批准筹建院重点实验室，2013年4月26日正式成立。实验室本部面积1200平方米，昌平研究基地面积4500平方米。

　　实验室副主任战爱斌研究员（主持工作）、邓晔研究员。实验室学术委员会主任康乐院士，副主任任南琪院士。实验室固定人员32人，其中研究体系29人（包括研究员10人、副研究员12人、助理研究员7人），支撑人员3人（包括技术人员1人，专职管理人员2人）。拥有杰青1人，优青1人，长江学者1人，万人计划领军人才1人，万人计划青年拔尖人才1人。实验室下设3个研究单元和4个科研支撑平台。实验室一直保持着活跃的国际交流与合作，与美国、英国、澳大利亚等国家的大学和科研机构建立了良好的科研合作关系。实验室现有海外荣誉教授和客座教授10人，其中院士6人。

　　实验室的定位是，面向学科前沿和国家重大需求，系统地开展环境生物技术的理论与应用研究。重点围绕着环境污染的生物 检测与诊断、环境污染的生物过程与效应、环境污染的生物控制原理与技术三个研究方向，探索生物技术主导的手段和方法，减小或修复环境污染对生物体及其生存 环境的危害，强调理论、技术、应用的紧密结合，产生具有科学突破和应用价值的创新成果。